Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP3Q96P20 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms