Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms