Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
WDR53Q7Z5U6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms