Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms