Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms