Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms