Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TAF1AQ15573 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TAF1AQ15573 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TAF1AQ15573 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TAF1AQ15573 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TAF1AQ15573 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TAF1AQ15573 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TAF1AQ15573 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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