Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SIX1Q15475 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SIX1Q15475 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SIX1Q15475 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SIX1Q15475 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SIX1Q15475 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SIX1Q15475 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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