Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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