Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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