Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPRHQ149N8 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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