Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms