Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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