Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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