Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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