Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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