Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
STRN3Q13033 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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