Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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AP1B1Q10567 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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AP1B1Q10567 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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AP1B1Q10567 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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AP1B1Q10567 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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