Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms