Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms