Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms