Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms