Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH1A3P47895 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms