Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBX2P40425 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBX2P40425 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PBX2P40425 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBX2P40425 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBX2P40425 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBX2P40425 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBX2P40425 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBX2P40425 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBX2P40425 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms