Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PPIFP30405 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PPIFP30405 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PPIFP30405 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PPIFP30405 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PPIFP30405 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PPIFP30405 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PPIFP30405 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PPIFP30405 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PPIFP30405 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PPIFP30405 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PPIFP30405 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PPIFP30405 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PPIFP30405 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PPIFP30405 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PPIFP30405 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PPIFP30405 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PPIFP30405 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PPIFP30405 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PPIFP30405 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PPIFP30405 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PPIFP30405 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PPIFP30405 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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