Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MSX1P28360 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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