Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCM3P25205 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCM3P25205 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCM3P25205 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms