Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KB1P23443 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms