Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRCP23327 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HRCP23327 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HRCP23327 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HRCP23327 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HRCP23327 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms