Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DESP17661 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DESP17661 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms