Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms