Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DMDP11532 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMDP11532 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
DMDP11532 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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