Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TYMSP04818 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TYMSP04818 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TYMSP04818 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TYMSP04818 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TYMSP04818 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TYMSP04818 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TYMSP04818 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms