Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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