Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGAP1Q9UPQ3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms