Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC17A6Q9P2U8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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