Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
A4GALTQ9NPC4 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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