Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms