Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms