Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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