Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SLC12A9Q9BXP2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms