Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT140Q96RY7 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms