Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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