Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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