Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF496Q96IT1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms