Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms