Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC33Q8N5R6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms