Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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LNX2Q8N448 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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LNX2Q8N448 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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LNX2Q8N448 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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LNX2Q8N448 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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LNX2Q8N448 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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LNX2Q8N448 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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LNX2Q8N448 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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