Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms