Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TRAPPC6BQ86SZ2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TRAPPC6BQ86SZ2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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